Genetics and Genomics Servicio de diseño de portadas de revistas (GWAS)

Journal of Genetics and Genomics

3 February 2023

Los análisis genómicos y transcriptómicos permiten la identificación de genes importantes asociados con el depósito de grasa subcutánea en vacas Holstein

Hailiang Zhang^a,1, Siyuan Mi^a,1, Luiz F. Brito^b, Lirong Hu^a, Lei Wang^a, Longgang Ma^a, Qing Xu^c, Gang Guo^d, Ying Yu^a,*, Yachun Wang^a,*

10.1016/j.jgg.2023.01.011

Los principales objetivos de este estudio son identificar genes candidatos clave que regulan la deposición de grasa subcutánea en vacas lecheras de alta producción mediante la integración de conjuntos de datos genómicos y transcriptómicos. Se utilizan un total de 1.654 vacas Holstein genotipadas para realizar un estudio de asociación de todo el genoma (GWAS) con el objetivo de identificar genes asociados con la deposición de grasa subcutánea. Posteriormente, se realizan análisis de redes de coexpresión genética ponderada (WGCNA) basándose en datos de secuenciación de ARN de 34 vacas y desviaciones del depósito de grasa subcutánea en el rendimiento de las vacas. Por último, se obtienen ARNm, ARNc y genes de empalme alternativo expresados diferencialmente (DE) para 12 vacas Holstein con fenotipos extremos y divergentes para la deposición de grasa subcutánea. Integrando todos los hallazgos, los genes NID2, STARD3, UFC1, DEDD, PPP1R1B y USP21 se consideran los genes candidatos más importantes que influyen en los rasgos de deposición de grasa subcutánea en las vacas Holstein.