Nucleic Acids Research
11 July 2022
Un algoritmo de agrupamiento de transformación y su aplicación en el perfil estructural de polirribosomas.
Wenhong Jiang1, Jonathan Wagner2,3, Wenjing Du1, Juergen Plitzko4, Wolfgang Baumeister2, Florian Beck4 and Qiang Guo1,5
1 Laboratorio Estatal Clave de Investigación de Proteínas y Genes Vegetales, Centro Peking-Tsinghua de Ciencias de la Vida, Academia de Estudios Interdisciplinarios Avanzados, Facultad de Ciencias de la Vida, Universidad de Pekín, Beijing 100871, China,
2 Departamento de Biología Molecular Estructural, Instituto Max Planck de Bioquímica, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Alemania,
3 Departamento de Bioquímica Celular, Instituto Max Planck de Bioquímica, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Alemania,
4 Tecnología CryoEM, Instituto Max Planck de Bioquímica, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Alemania,
5 Laboratorio Changping, Pekín, China
10.1093/nar/gkac547
Las mejoras en la preparación de muestras de tomografía crioelectrónica, los instrumentos de microscopía electrónica y los algoritmos de procesamiento de imágenes han avanzado en el análisis estructural de macromoléculas in situ. Más allá de tales análisis de macromoléculas individuales, el estudio de sus interacciones con vecinos funcionalmente relacionados en hábitats celulares abarrotados, es decir, la "sociología molecular", es de fundamental importancia en biología. Aquí presentamos un algoritmo de agrupación de topologías de moléculas vecinas (NEMO-TOC). Optimizamos este algoritmo para la detección y elaboración de perfiles de polirribosomas, que desempeñan funciones tanto constitutivas como reguladoras en la expresión génica. Nuestros resultados sugieren un modelo en el que los polisomas se forman conectando múltiples bloques no estocásticos, en el que la traducción probablemente esté sincronizada.
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